Marcus Nispel commence sa carrière en 1984 en tant que directeur artistique chez un grand publiciste. En 1989 il commence à réaliser des clips vidéo (pour Elton John, les Spice Girls, Janet Jackson, Aretha Franklin, Cher, Mariah Carey, George Michael, Billy Joel, Mylène Farmer, Etienne Daho, Alain Chamfort, Pascal Obispo, et bien d'autres vedettes encore).
En 2003, il est choisi par Michael Bay pour réaliser Massacre à la tronçonneuse, le remake du classique de Tobe Hooper. Le film connaît un succès notable au box office, et ce malgré des critiques plutôt défavorables, mais installe toutefois Marcus Nispel en tant que réalisateur. En 2007, il sort son second film pour le cinéma (après un téléfilm, Frankenstein): Pathfinder. Encore une fois, les critiques sont négatives.
En 2008, toujours pour le producteur Michael Bay il s'attaque à un autre remake du cinéma d'horreur: Vendredi 13. Et comme précédemment, les critiques sont assassines envers son travail, alors même que le film connaît un gros succès au box office.
En 2010, il s'attaque de nouveau au remake d'un classique, cette fois-ci c'est au tour de Conan de passer entre les mains du cinéaste allemand.
 
Marcus Nispel compte à ce jour plus d'un millier de publicités réalisées, et un nombre impressionnant de vidéo clips.